Tην παραίτησή του, ενώ βρίσκεται στην τελική ευθεία για την αποκρατικοποίησή της η εταιρεία υπέβαλε ο πρόεδρος και διευθύνων σύμβουλος της ΤΡΑΙΝΟΣΕ Θανάσης Ζηλιασκόπουλος.
Μέχρι στιγμής δεν έχει γίνει γνωστό αν η παραίτηση έχει γίνει αποδεκτή από το ΤΑΙΠΕΔ, που είναι μέτοχος της ΤΡΑΙΝΟΣΕ. Σύμφωνα με πληροφορίες, ο επικεφαλής της ΤΡΑΙΝΟΣΕ εξέταζε από καιρό το ενδεχόμενο αποχώρησης από την εταιρεία, καθώς θεωρούσε ότι είχε κλείσει τον κύκλο του. Ωστόσο, έλαβε την απόφαση να φύγει με αφορμή το κλείσιμο της σιδηροδρομικής γραμμής στην Ειδομένη από μετανάστες, που προκάλεσε σοβαρό πρόβλημα αξιοπιστίας για την ΤΡΑΙΝΟΣΕ.